====== Bienvenue sur le Wiki des Projets XPER ======

Ce wiki est dédié à l'utilisation et la documentation des logiciels Xper2, Xper3, Mkey, Ikey.

====== Xper3 ======

 **Xper3** est la Version collaborative en ligne accessible à partir d'une connexion internet.

    
**[[userManualXper3| Documentation Xper3]]**

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====== Xper2 ====== 

**Xper2** est une Version "desktop" développée en Java.

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====== Identification ======
IdentificationKey est un ensemble d'applications d'identification reposant sur des services web de type REST.

===== MKey+ =====

Mkey est l'application d'identification interactive

  * [[mkey|Documentation utilisateur MKey]]

===== Ikey+ =====

IKey est l'application permettant d'obtenir une clé d'identification statique

  * [[ikey|Documentation utilisateur IKey]]

====== Exemples d'applications de clés interractives ======

Ces applications utilisent Mkey

  * [[Applications|Quelques applications...]]

====== Ressources======

** Exemples de publications sur des applications Xper3 ou Xper2** 

  * Saucède, T., Eléaume, M., Jossart, Q., Moreau, C., Downey, R., Bax, N., . . . Vignes-Lebbe, R. (2020). Taxonomy 2.0: Computer-aided identification tools to assist Antarctic biologists in the field and in the laboratory. Antarctic Science, 1-13. doi:10.1017/S0954102020000462

  * Stéphanie Bodin, Rita Scheel-Ybert, Jacques Beauchene, Jean-François Molino, Laurent Bremond. CharKey: An electronic identification key for wood charcoals of French Guiana. IAWA Journal, Brill publishers, (2019), 40 (1), pp.75-S20. ⟨10.1163/22941932-40190227⟩. ⟨hal-02098432⟩

  * Klimmek F, Baur H (2018) An interactive key to Central European species of the Pteromalus albipennis species group and other species of the genus (Hymenoptera: Chalcidoidea: Pteromalidae), with the description of a new species. Biodiversity Data Journal 6: e27722. https://doi.org/10.3897/BDJ.6.e27722  
 
  * DUBUISSON J.-Y., BOUQUIN S. & VIGNES-LEBBE R., 2018.– Computer assisted identification: Xper and Orchids of France. L’Orchidophile 219: 311-318.

  * Jouveau S, Delaunay M, Vignes-Lebbe R, Nattier R (2018) A multi-access identification key based on colour patterns in ladybirds (Coleoptera, Coccinellidae). ZooKeys 758: 55-73. https://doi.org/10.3897/zookeys.758.22171

  * Saïd A, Hennequin S, Rouhan G, Dubuisson J (2017) Disentangling the diversity and taxonomy of Hymenophyllaceae (Hymenophyllales, Polypodiidae) in the Comoros. European Journal of Taxonomy 313: 1‑53. https://doi.org/10.5852/ejt.2017.313
        
  * Engel J, Brousseau L, Baraloto C (2016) GuiaTreeKey, a multi-access electronic key to identify tree genera in French Guiana. PhytoKeys 68: 27-44. https://doi.org/10.3897/phytokeys.68.8707

  * Vignes Lebbe R, Chesselet P, Diep Thi MH (2015) Xper3: new tools for collaborating, training and transmitting knowledge on botanical phenotypes. In: Rakotoarisoa NR, Blackmore S, Riéra B (Eds) Botanists of the 21st century. 11 pp. [ISBN|978-92-3-100120-8].

  * Corvez A, Grand A (2014) Enabling comparisons of characters using an Xper2 based knowledge-base of fern morphology. Phytotaxa 183 (3): 145‑158. https://doi.org/10.11646/phytotaxa.183.3.2

  * Louveaux A., Amédégnato C.†, Poulain S. & Desutter-Grandcolas L.2013 — Catalogue and keys of the Acridomorpha (Insecta, Orthoptera) from north West Africa. Zoosystema 35 (2): 175-181. http://dx.doi.org/10.5252/z2013n2a3

  * Romain Thomas, « Anatomy of the endemic palms of the Near and Middle East: archaeobotanical perspectives », Revue d’ethnoécologie [En ligne], 4 | 2013, mis en ligne le 31 décembre 2013, consulté le 13 novembre 2018. URL : http://journals.openedition.org/ethnoecologie/1366 ; DOI : 10.4000/ethnoecologie.1366

  * Kerner A (2012) Archaeocyatha, a computer-aided identification of genera. Geologica Belgica 15 (4): 209‑214.

  * Mathieu B, Cêtre-Sossah C, Garros C, Chavernac D, Balenghien T, Carpenter S, Setier-Rio M, Vignes-Lebbe R, Ung V, Candolfi E, Delécolle J (2012) Development and validation of IIKC: an interactive identification key for Culicoides (Diptera: Ceratopogonidae) females from the Western Palaearctic region. Parasites & Vectors 5 (1): 137. https://doi.org/10.1186/1756-3305-5-137

  * Ung V, Dubus G, Zaragüeta-Bagils R, Vignes-Lebbe R (2010) Xper²: introducing e-Taxonomy. Bioinformatics 26 (5): 703‑704. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btp715


** Exemple de bases de connaissances (voir Applications) **

[[http://orchidees-france.identificationkey.org|Orchidées de France]]  

[[http://empreintes-carnivores-de-france.identificationkey.org	Empreintes|de carnivores de France]]

[[http://spipoll.snv.jussieu.fr/mkey/mkey-spipoll.html|Insectes visiteurs de fleurs]] 

[[http://chouettes-hiboux-de-france.identificationkey.org|Chouettes et Hiboux de France]]

[[http://feuilles-des-arbres-france.identificationkey.org|Feuilles des arbres de France]]


====== Pour démarrer ======

[[https://www.dokuwiki.org/wiki:syntax|Syntaxe Dokuwiki]]